《手游二战风云二》虽然在部分情节上尽力还原了二战背景，但在历史还原度上仍有不小的争议。某些国家的军事力量和战斗策略与历史事实有出入，比如一些小国的军队被赋予了过于夸张的实力，或者某些著名战役的结果可以被玩家轻易改写。这种历史的灵活性虽然增强了游戏的可玩性，但也让严格的历史爱好者对其准确性有所保留。
资源在《手游二战风云二》中扮演重要角色，但玩家们发现，游戏在资源分配上有一定的随机性，导致有时候后期游戏的资源配置变得极富挑战性。有的玩家可能在初期阶段就由于资源丰富而占据优势，而有的国家却面临资源枯竭的窘境。资源配置是否公平合理，以及如何有效平衡各国之间的社会经济发展，成为玩家讨论的焦点。
在《手游二战风云二》中，玩家不仅要面对来自其他玩家的挑战，还要应对AI控制的敌对势力。游戏的AI表现时常成为玩家吐槽的对象，尤其是在某些情景下，AI要么表现过于“聪明”，采取战术和策略让人措手不及；要么过于迟钝，无法提供足够的挑战性。AI行为逻辑的合理性和战术变化的多样性，还需进一步优化。
由于《手游二战风云二》包含了丰富的武器系统和技术树，玩家可以根据自己的战略需要进行兵器的选择和升级。但是不同武器之间的平衡性让人不禁提出疑问：某些单位的性价比是否过高？某些武器升级是否对战局的影响过大或过小？在实战中，玩家们经常会发现某些特定组合的战术几乎无敌，对此游戏平衡性的调整也是玩家们普遍关心的问题。
网络游戏的稳定性对于提供流畅的游戏体验至关重要，《手游二战风云二》在这方面也有亟待改进之处。玩家在多人在线对战中经常会遭遇网络延迟，甚至掉线现象，这直接影响到了游戥的公平性和连贯性。虽然游戏开发商在不断对服务器进行优化，但是这方面的体验仍旧需要玩家和开发者共同关注与解决。
《手游二战风云二》和许多手游一样，提供了内购选项让玩家可以通过支付真实货币来获取游戏资源或者快速度过难关。对于这一点，玩家社区中的意见比较两极。一些玩家认为，内购系统导致了游戏的不平衡，使得有支付能力的玩家比普通玩家占有优势。如何确保付费玩家和非付费玩家之间能享有公平的游戏体验，是游戏开发者面临的重要课题。
《手游二战风云二》为了维持游戏的新鲜感和竞争力，不断推出更新和补丁。尽管这有利于游戏的长期发展，但每次大的更新之后，职业玩家和高级玩家必须迅速适应新的游戏环境和规则，这对于他们的战术布局和资源管理策略是一个不小的挑战。对于普通玩家而言，新功能和变更可能造成混淆和不适应，也影响了游戏体验。
尽管《手游二战风云二》成功地为玩家打造了一个沉浸式的第二次世界大战环境，但在历史准确性、资源分配、AI智能、武器平衡、网络稳定性、内购平衡以及更新影响等方面仍有诸多挑战和难题需要解决。玩家和开发者之间的积极沟通与合作，有望将《手游二战风云二》打磨得更加精致和完善。
